| 順位 | 組-順 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 5-1 | 利光 凛人(5) 大分 | 大分中央陸上 | 2'30"93 | 大会新 |
| 2 | 5-2 | 大塚 太陽(5) 福岡 | 芦屋JC | 2'32"60 | |
| 3 | 5-3 | 小倉 瑠隼(5) 大分 | 臼杵ｼﾞｭﾆｱ | 2'33"46 | |
| 4 | 5-4 | 福重 玲央(5) 福岡 | 芦屋JC | 2'35"71 | |
| 5 | 5-5 | 川野 颯亮(5) 大分 | 豊後高田陸上 | 2'38"60 | |
| 6 | 5-6 | 河合 駿太(5) 大分 | 滝尾陸上 | 2'38"63 | |
| 7 | 5-7 | 和才 奈月(5) 大分 | なかつ楽走C | 2'41"49 | |
| 8 | 3-1 | 永沼 一汰(5) 福岡 | 芦屋JC | 2'42"73 | |
| 9 | 4-1 | 溝邉 晋作(5) 大分 | 挾間陸上 | 2'45"30 | |
| 10 | 4-2 | 森田 煌明(5) 大分 | 大分中央陸上 | 2'46"38 | |
| 11 | 4-3 | 後藤 祝仁(5) 大分 | 臼杵ｼﾞｭﾆｱ | 2'49"67 | |
| 12 | 4-4 | 山本 昇汰(5) 大分 | 滝尾陸上 | 2'50"36 | |
| 13 | 4-5 | 尾関 岳(5) 大分 | 三光陸上 | 2'50"50 | |
| 14 | 4-6 | 永元 詩音(5) 大分 | ななせ陸上 | 2'51"93 | |
| 15 | 3-2 | 関谷 永碧(5) 大分 | ななせ陸上 | 2'52"57 | |
| 16 | 2-1 | 坂田 琥宇(5) 福岡 | 芦屋JC | 2'52"89 | |
| 17 | 4-7 | 吉田 湊(5) 大分 | 臼杵ｼﾞｭﾆｱ | 2'53"85 | |
| 18 | 3-3 | 木薮 瑛斗(5) 大分 | ななせ陸上 | 2'53"97 | |
| 19 | 1-1 | 西谷 蓮人(5) 大分 | 院内陸上 | 2'54"84 | |
| 20 | 3-4 | 粟津 遥翔(5) 大分 | 臼杵ｼﾞｭﾆｱ | 2'55"22 | |
| 21 | 2-2 | 栗﨑 正充(5) 大分 | 豊後高田陸上 | 3'00"21 | |
| 22 | 2-3 | 髙倉 秀路(5) 大分 | 三光かけっこ | 3'01"64 | |
| 23 | 3-5 | 小畑龍太郎(5) 大分 | 臼杵ｼﾞｭﾆｱ | 3'02"07 | |
| 24 | 2-4 | 桑原 丸(5) 大分 | 三光陸上 | 3'02"30 | |
| 25 | 1-2 | 美濃部絢心(5) 大分 | 三光陸上 | 3'04"83 | |
| 26 | 2-5 | 關 帆高(5) 大分 | 豊後高田陸上 | 3'05"33 | |
| 27 | 2-6 | 黒枝 渉(5) 大分 | 臼杵ｼﾞｭﾆｱ | 3'05"66 | |
| 28 | 1-3 | 田中 悠真(5) 大分 | 安心院陸上 | 3'07"27 | |
| 29 | 1-4 | 森崎 舜一(5) 大分 | AC佐伯 | 3'09"31 | |
| 30 | 2-7 | 松田 凌士(5) 大分 | 三光かけっこ | 3'12"75 | |
| 31 | 1-5 | 野田 叶(5) 大分 | 豊後高田陸上 | 3'21"44 | |
| 32 | 1-6 | 佐藤 栞大(5) 大分 | 三光陸上 | 3'22"23 | |
| 3- | 小森 遥斗(5) 大分 | 安心院陸上 | 欠場 | ||
| 1- | 渋谷 晏弘(5) 大分 | 三光かけっこ | 欠場 | ||
| 3- | 濱野 晃綺(5) 大分 | AC佐伯 | 欠場 |